Tout comme la vallée de Delémont, le district de Moutier est délimité par les montagnes du Jura. Moutier se trouve à 10 km à vol d’oiseau de Delémont, mais il faut 10-15 min pour parcourir les Gorges de Moutier, qui séparent les deux cités. La ville prévôtoise se situe à l’intersection des Petit-Val et Grand-Val, et de deux cluses, les Gorges de Court et les Gorges de Moutier. Ces dernières, traversées par la Birse, sont reconnues comme site géologique d'importance européenne. Elles offrent un des visages les plus typiques du Jura plissé. Au sud de ces gorges s’étend la vallée de Tavannes.
